MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 37883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017927	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017927	T	7	7	75	81	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017927	T	8	8	203	210	0 %	100 %	0 %	0 %	387908809
4	NC_017927	AGA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908809
5	NC_017927	ATT	2	6	262	267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908809
6	NC_017927	TCA	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908809
7	NC_017927	GAA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908809
8	NC_017927	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908809
9	NC_017927	AAC	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908809
10	NC_017927	AGTA	2	8	534	541	50 %	25 %	25 %	0 %	387908809
11	NC_017927	AGC	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908809
12	NC_017927	TAGCTG	2	12	598	609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387908809
13	NC_017927	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908809
14	NC_017927	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908809
15	NC_017927	GTTT	2	8	761	768	0 %	75 %	25 %	0 %	387908809
16	NC_017927	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908809
17	NC_017927	ATA	3	9	916	924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908809
18	NC_017927	TGAA	2	8	964	971	50 %	25 %	25 %	0 %	387908809
19	NC_017927	GGA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908809
20	NC_017927	TGCT	2	8	1489	1496	0 %	50 %	25 %	25 %	387908809
21	NC_017927	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017927	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017927	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017927	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017927	TAA	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908810
26	NC_017927	A	6	6	1776	1781	100 %	0 %	0 %	0 %	387908810
27	NC_017927	AGA	2	6	1887	1892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908810
28	NC_017927	ATTA	2	8	1905	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	387908810
29	NC_017927	GTA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908810
30	NC_017927	T	6	6	1944	1949	0 %	100 %	0 %	0 %	387908810
31	NC_017927	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908810
32	NC_017927	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908810
33	NC_017927	AAAGG	2	10	2050	2059	60 %	0 %	40 %	0 %	387908810
34	NC_017927	AAG	2	6	2084	2089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908810
35	NC_017927	GCA	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908810
36	NC_017927	GTC	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908810
37	NC_017927	GTA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908810
38	NC_017927	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908810
39	NC_017927	TCT	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908810
40	NC_017927	CAAAT	2	10	2387	2396	60 %	20 %	0 %	20 %	387908810
41	NC_017927	AC	3	6	2426	2431	50 %	0 %	0 %	50 %	387908810
42	NC_017927	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908810
43	NC_017927	TGAA	2	8	2636	2643	50 %	25 %	25 %	0 %	387908810
44	NC_017927	TGATT	2	10	2673	2682	20 %	60 %	20 %	0 %	387908810
45	NC_017927	ACTT	2	8	2698	2705	25 %	50 %	0 %	25 %	387908810
46	NC_017927	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908810
47	NC_017927	AATT	2	8	2813	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	387908810
48	NC_017927	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017927	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017927	GAA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908811
51	NC_017927	A	7	7	2957	2963	100 %	0 %	0 %	0 %	387908811
52	NC_017927	ATG	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908811
53	NC_017927	GTC	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908811
54	NC_017927	AAG	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908811
55	NC_017927	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017927	AAAT	3	12	3286	3297	75 %	25 %	0 %	0 %	387908812
57	NC_017927	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908812
58	NC_017927	GCT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908812
59	NC_017927	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908812
60	NC_017927	TCGT	2	8	3603	3610	0 %	50 %	25 %	25 %	387908812
61	NC_017927	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
62	NC_017927	AAAGAT	2	12	3770	3781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387908812
63	NC_017927	TTC	2	6	3801	3806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908812
64	NC_017927	AGA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
65	NC_017927	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
66	NC_017927	A	6	6	3873	3878	100 %	0 %	0 %	0 %	387908812
67	NC_017927	ACA	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908812
68	NC_017927	TGA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
69	NC_017927	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
70	NC_017927	AGT	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
71	NC_017927	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
72	NC_017927	GAT	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
73	NC_017927	GCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908812
74	NC_017927	AGC	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908812
75	NC_017927	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
76	NC_017927	GAA	2	6	4349	4354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
77	NC_017927	TGT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908812
78	NC_017927	A	6	6	4417	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017927	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908813
80	NC_017927	TAG	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908813
81	NC_017927	CAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908813
82	NC_017927	ATCT	2	8	4686	4693	25 %	50 %	0 %	25 %	387908813
83	NC_017927	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908813
84	NC_017927	GGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908813
85	NC_017927	GAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908813
86	NC_017927	CAG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908813
87	NC_017927	TACT	2	8	4965	4972	25 %	50 %	0 %	25 %	387908813
88	NC_017927	ACT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908813
89	NC_017927	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908814
90	NC_017927	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
91	NC_017927	TAG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
92	NC_017927	T	7	7	5288	5294	0 %	100 %	0 %	0 %	387908814
93	NC_017927	GAT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
94	NC_017927	GCT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
95	NC_017927	A	6	6	5338	5343	100 %	0 %	0 %	0 %	387908814
96	NC_017927	GGAA	2	8	5482	5489	50 %	0 %	50 %	0 %	387908814
97	NC_017927	G	6	6	5578	5583	0 %	0 %	100 %	0 %	387908814
98	NC_017927	T	6	6	5634	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	387908814
99	NC_017927	GAGAT	2	10	5641	5650	40 %	20 %	40 %	0 %	387908814
100	NC_017927	TGT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
101	NC_017927	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387908814
102	NC_017927	AGA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908814
103	NC_017927	TC	3	6	5883	5888	0 %	50 %	0 %	50 %	387908814
104	NC_017927	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
105	NC_017927	TCA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
106	NC_017927	ACT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
107	NC_017927	CAGC	2	8	6090	6097	25 %	0 %	25 %	50 %	387908814
108	NC_017927	CTT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908814
109	NC_017927	CA	3	6	6161	6166	50 %	0 %	0 %	50 %	387908814
110	NC_017927	TCG	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
111	NC_017927	TAG	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
112	NC_017927	GTT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
113	NC_017927	A	6	6	6444	6449	100 %	0 %	0 %	0 %	387908814
114	NC_017927	CGT	2	6	6456	6461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
115	NC_017927	TGT	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
116	NC_017927	ACT	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
117	NC_017927	TGC	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
118	NC_017927	TC	3	6	6668	6673	0 %	50 %	0 %	50 %	387908814
119	NC_017927	TAA	2	6	6710	6715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908814
120	NC_017927	ATG	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
121	NC_017927	CAAA	2	8	6743	6750	75 %	0 %	0 %	25 %	387908814
122	NC_017927	AAGC	2	8	6755	6762	50 %	0 %	25 %	25 %	387908814
123	NC_017927	GAT	3	9	6840	6848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
124	NC_017927	TTGG	2	8	6960	6967	0 %	50 %	50 %	0 %	387908814
125	NC_017927	TGC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
126	NC_017927	ATG	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
127	NC_017927	A	6	6	7149	7154	100 %	0 %	0 %	0 %	387908814
128	NC_017927	ATT	3	9	7200	7208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908814
129	NC_017927	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
130	NC_017927	TGA	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
131	NC_017927	AAC	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908814
132	NC_017927	ATT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908814
133	NC_017927	TTATG	2	10	7448	7457	20 %	60 %	20 %	0 %	387908814
134	NC_017927	T	6	6	7519	7524	0 %	100 %	0 %	0 %	387908814
135	NC_017927	CT	3	6	7642	7647	0 %	50 %	0 %	50 %	387908814
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254	NC_017927	TTG	2	6	12781	12786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908821
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260	NC_017927	CCTT	2	8	13115	13122	0 %	50 %	0 %	50 %	387908821
261	NC_017927	T	7	7	13138	13144	0 %	100 %	0 %	0 %	387908821
262	NC_017927	ATG	2	6	13152	13157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908821
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